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[讲座通知]单细胞测序以及空间转录组学阐释生物细胞的意义推动精准医疗发展——2023年10月25日下午2点30分福建省立医院8号楼6层国际学术厅

发布时间:2023-10-18 11:42  点击数:

时间:10月25日下午2点30分

地点:8号楼6层国际学术厅

主题:  单细胞测序以及空间转录组学阐释生物细胞的意义推动精准医疗发展

讲者:徐肖江博士  

附徐肖江简介:

徐肖江简历

徐肖江博士是全球高通量数据分析和质量控制协会(MAQC, Massive Analysis and Quality Control Society),高通量单细胞测序分会主委。从 2007 年起,一直致力于开发和应用各种生物计算算法和工具去模建和分析各种生物大数据,包括基因表达谱,全基因组测序,表达谱测序等各种二代测序数据,是第二代测序数据分析技术的领军人物。从 2016 年底开始在美国国家健康研究院环境与健康科学研究所领导建立第三代基因测序和高通量单细胞测序的平台;至今已成功开展二十几种样品类型几百个样本的应用研究,包括人和小鼠的肺脏,乳腺,骨关节,全脑,皮肤,外周血,肝脏,心脏,睾丸,直肠,细胞系等。与几十个研究组有合作,内容涉及各种癌症发生与发展的分子机理,激素作用分子机制,污染物致病用的分子机理等;研究领域包括基因组学,分子遗传学,表观遗传学,激素,免疫学,毒物学。同时关注转化医学,及时把研究成果应用到临床, 如精准医疗。到目前为止已发表 SCI 收录论文五十多篇,包括自然(Nature),Nature Biotechnology, 自然通讯(Nature Communication), Cell StemCell, Cell Metabolism, Nature Metabolism, Immunity, Journal Clinical Investigation, Cell

Report, 分子细胞(Molecular Cell), Cell Discovery, Gastroenterology, EMBO Journal,eLife,Bioinformatics(生物信息学) 和 JBC 等全球顶级杂志,是国内外多家顶级专业杂志的审稿人。2022 年加入美国杜兰大学医学院检验医学系,建立自己的新的实验室,主要研究方向是建立和开发高通量单细胞测序和空间转录组学数据的深度学习算法和工具,同时应用这些工具进一步研究发育,免疫和各种复杂性疾病。

教育经历:

2001 - 2005,中科院生物化学和细胞生物学研究所,生物信息学,博士

1998 – 2001,浙江大学,硕士

1994/9 – 1998/7,浙江大学,生物系,学士

工作经历(科研与学术工作经历):

2022-至今 美国杜兰大学医学院,教授

2012 - 2022,美国国立环境健康科学研究所 (NIEHS, NIH),资深生物信息学研究员

2021-2022 : Tulane University,兼职教授

2015-2017: 浙江温州医科大学,客座教授2011 – 2012,美国弗吉尼亚大学,资深计算生物学研究员

2008 – 2011,美国弗吉尼亚大学,计算生物学研究员

2005 – 2008,美国国立卫生研究院(NIH),癌 症研究所(NCI),生物统计学,博士后